Rond 1579 werd de “baaierd” van het Sint Joris Gasthuis ( = passantenhuis / misschien ook gevangenis) gesloten. Hierdoor werd de functie steeds nadrukkelijker het opnemen van krankzinnigen.
Onderdeel van het stedelijk armenbestuur
In 1597 wordt in Delft de Kamer van Charitate opgericht. Ook het Sint Joris Gasthuis kwam onder het beheer van het stedelijk armenbestuur.
Na de Tachtigjarige Oorlog bestond de katholieke armenzorg niet meer. De stedelijke overheid nam die taak over.
In 1579 wordt het St. Barbara-klooster ingericht als weeshuis. Bij de oprichting van de Kamer van Charitate in 1597 kwam ook het Sint Joris Gasthuis onder het beheer van het stedelijk armenbestuur. Dit bestuur heette vanaf 1618 de Kamer van Charitate. De Kamer van Charitate beheerde de inkomsten van zowel het Weeshuis als het Sint Joris Gasthuis. Beide instellingen waren zelfstandig, maar kunnen daardoor overschotten en tekorten aan elkaar overdragen.